記者今晨從英國《自然》雜志子刊《自然-生物技術(shù)》雜志獲悉,發(fā)表在《自然-生物技術(shù)》上的題為“利用NgAgo進(jìn)行DNA引導(dǎo)的基因組編輯”的論文于美國時(shí)間2017年8月2日(北京時(shí)間8月3日)撤稿了。論文作者韓春雨等人也同時(shí)發(fā)出撤稿聲明。
撤稿聲明寫道,由于科研界一直無法根據(jù)我們論文提供的實(shí)驗(yàn)方案重復(fù)出論文圖4所示的關(guān)鍵結(jié)果,我們決定撤回這項(xiàng)研究。在該圖中,我們報(bào)告說,利用5′磷酸化單鏈DNA作為引導(dǎo),NgAgo(Natronobacterium gregoryi Argonaute)能夠有效引起雙鏈斷裂,并對人體細(xì)胞基因組進(jìn)行編輯。雖然許多實(shí)驗(yàn)室都進(jìn)行了努力(Protein Cell 7, 913-915, 2016; Nat. Biotechnol.35, 17-18, 2017; Cell Res.26, 1349-1352, 2016; PLOS One 12, e0177444, 2017) ,但是沒有獨(dú)立重復(fù)出這些結(jié)果的報(bào)告。因此,我們現(xiàn)在撤回我們的最初報(bào)告,以維護(hù)科學(xué)記錄的完整性。不過,我們會繼續(xù)調(diào)查該研究缺乏可重復(fù)性的原因,以提供一個(gè)優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)方案。
此外,《自然-生物技術(shù)》今天同時(shí)也發(fā)表了一篇關(guān)于此次撤稿的社論。
以下為社論全文:
在社論中,一項(xiàng)宣稱通過Argonaute酶實(shí)現(xiàn)基因編輯的研究被撤回,這顯示了論文發(fā)表后的同行評議在全天候媒體時(shí)代的重要性。
韓春雨的這篇論文自去年發(fā)表后所產(chǎn)生的影響力,再怎么夸張地說也不為過,尤其是在論文的來源地中國。中國媒體紛紛進(jìn)行報(bào)道,以大標(biāo)題宣告一項(xiàng)全新基因編輯系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)。這無疑是一篇中國去年被報(bào)道最多的論文;媒體監(jiān)測公司融文(Meltwater)的數(shù)據(jù)顯示,僅在論文發(fā)表后的最初兩個(gè)月,就有將近4000篇相關(guān)的中文新聞報(bào)道。
NgAgo的轟動之處集中在它有可能補(bǔ)充,甚至取代CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)之一點(diǎn)上。NgAgo有望以一個(gè)目標(biāo)序列進(jìn)行基因編輯(Cas9不僅需要目標(biāo)序列,還需要另外一個(gè)附近的識別(PAM)序列)。而且,初始數(shù)據(jù)還顯示了它在其它方面的優(yōu)勢,如引物的穩(wěn)定性更強(qiáng)(DNA相對于Cas9采用的RNA),增強(qiáng)特異性,減少基因組編輯脫靶,改善在基因組富含GC區(qū)域的活性,以及使所用的試劑更易于合成和處理。
如果說這一切都聽上去太過美好而令人難以置信,那么去年夏天以來,隨著越來越多的實(shí)驗(yàn)室無法重復(fù)該論文所報(bào)告的基因組編輯功能,質(zhì)疑聲便開始出現(xiàn)了。在各種基因組編輯會議上,在新聞討論組和電子郵件中,這篇論文成為最熱話題之一。這很快便引起媒體注意,有關(guān)該初始報(bào)告有效性的正反兩方面的聲音開始交鋒。我們內(nèi)部的圖像完整性篩查沒有發(fā)現(xiàn)韓春雨論文的明顯異常,復(fù)查數(shù)據(jù)的三位外部評審人也持相同觀點(diǎn)。
在此期間,《自然-生物技術(shù)》一直與科研界保持聯(lián)絡(luò),關(guān)注各種為重復(fù)論文所做的持續(xù)努力。最終,在編輯們的協(xié)調(diào)下,三個(gè)獨(dú)立小組的成果形成了一篇單獨(dú)的反駁性論文,并通過了同行評議(Nat. Biotechnol.34, 768-773, 2016)。有了這些數(shù)據(jù),我們就有充分的理由去提醒讀者留意該論文可能存在問題,我們將正式的“編輯部關(guān)注”發(fā)表在該篇論文所在的網(wǎng)址上,此舉得到包括韓春雨在內(nèi)的兩位論文作者的支持。
我們也詢問了論文作者是否可以解答科研界為何難以重復(fù)他們的結(jié)果。于是,去年12月,韓春雨及同事,還有另外幾個(gè)與本刊聯(lián)系的獨(dú)立研究小組,提供了新的數(shù)據(jù),稱已經(jīng)重復(fù)了NgAgo基因編輯活性。當(dāng)時(shí),本刊編輯和一位外部評審人都判定這些數(shù)據(jù)太過初級,不滿足發(fā)表標(biāo)準(zhǔn)。因此,我們決定給這些原始論文作者和新的研究小組更多時(shí)間來收集更多的能支持其論點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。
現(xiàn)在,距原論文發(fā)表已過去了一年多,我們了解到當(dāng)初曾報(bào)告說初步成功重復(fù)出實(shí)驗(yàn)結(jié)果的獨(dú)立研究小組,無法強(qiáng)化初始數(shù)據(jù),使其達(dá)到可發(fā)表的水平。類似的,在征求專家評審人的反饋意見后,我們判定韓春雨及同事提供的最新數(shù)據(jù)不足以反駁大量與其初始發(fā)現(xiàn)相悖的證據(jù)。我們現(xiàn)在確信韓春雨的撤稿決定是維護(hù)已發(fā)表科研記錄完整性的最好做法。
這篇有關(guān)NgAgo的論文發(fā)表出來,并不是科研過程的結(jié)束,而是開始。與任何其它發(fā)表出來的報(bào)告一樣,正是廣大的科研共同體對相關(guān)方法進(jìn)行了檢驗(yàn),識別潛在的錯(cuò)誤來源,驗(yàn)證試劑并優(yōu)化試驗(yàn)。在本例中,有多位敬業(yè)的研究者個(gè)人對已發(fā)表實(shí)驗(yàn)方法的各種細(xì)節(jié)進(jìn)行檢驗(yàn),并完成記錄翔實(shí)和有對照組的反駁性研究 (Protein Cell 7, 913, 2016; Cell Res.26, 1349-1352, 2016; PLoS ONE, 12, e0177444, 2017)。
這篇NgAgo論文也顯示了社交媒體的利與弊。顯然,這些平臺對于迅速提醒廣大科學(xué)界留意該論文可能存在的問題發(fā)揮了重要作用。但是,它們也抬高了人們的預(yù)期,以為有關(guān)這篇論文的問題是直截了當(dāng),可以快速解決的。然而,關(guān)于NgAgo的各種問題是無法在幾個(gè)星期或幾個(gè)月內(nèi)就能澄清的,這是有原因的。即使是簡單的實(shí)驗(yàn)也需要花費(fèi)數(shù)周來準(zhǔn)備、實(shí)施、分析和解決出現(xiàn)的問題。另外于事無益的是,那些進(jìn)行可重復(fù)性研究的人,其付出的努力往往得不到回報(bào)——這樣的工作單調(diào)乏味,沒有資金支持,還吃力不討好。
難怪在希望得到快速、明確答案的全天候媒體和公眾眼中,論文發(fā)表后的同行評議流程似乎慢得讓人沮喪。但是,當(dāng)涉及生物學(xué)時(shí),往往沒有明確的答案。當(dāng)研究重復(fù)性時(shí),有一點(diǎn)我們是知道的,那就是這需要花時(shí)間來做。就這篇有關(guān)NgAgo的論文而言,現(xiàn)在是時(shí)候了,數(shù)據(jù)已經(jīng)說話了。
2016年5月,中國河北科技大學(xué)的韓春雨及其團(tuán)隊(duì)在全球著名學(xué)術(shù)刊物《自然》的子刊《自然-生物技術(shù)》上報(bào)告發(fā)明了一種新的基因編輯技術(shù)NgAgo-gDNA。論文稱,與當(dāng)前基因編輯領(lǐng)域內(nèi)的主流技術(shù)CRISPR-Cas9相比,NgAgo-gDNA在一些方面具有優(yōu)勢。但隨后中國以及國外都有學(xué)者公開表示無法重復(fù)論文中描述的實(shí)驗(yàn),這項(xiàng)研究成果遭到多方質(zhì)疑。(記者 黎史翔)
您需要登錄后才可以評論, 登錄| 注冊
于詩詞盛宴中看見書香霞浦2024-05-28
閩南網(wǎng)推出專題報(bào)道,以圖、文、視頻等形式,展現(xiàn)泉州在補(bǔ)齊養(yǎng)老事業(yè)短板,提升養(yǎng)老服